Regex flags следует указывать внутри (?)
перед регулярным выражением, например извлечь из mbox только тела писем:
pcregrep -v -M '(?sU)^From .*^$' Mail/1.mbox
Извлечь тела писем можно и
formail -I "" -s cat < Mail/1.mbox
это просто пример использования сабжа.